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El Tribunal Electoral de Panamá garantiza la independencia de sus decisiones al contar con magistrados designados por los tres poderes del Estado (Ejecutivo, Legislativo y Judicial).
Los magistrados y sus suplentes ejercen sus funciones por un periodo de 10 años.
La directiva se elige en el mes de enero y está compuesta por un presidente, primer vicepresidente y segundo vicepresidente y es elegida cada dos años por los propios magistrados.
De acuerdo con la Ley Orgánica del Tribunal Electoral, los miembros de la junta directiva podrán ser reelegidos en sus cargos.
La nueva junta directiva que regirá desde enero de 2025 hasta enero del 2026 está conformada de la siguiente manera:
Las decisiones se toman por mayoría de votos en el Pleno, donde los tres magistrados exponen sus puntos de vista.
El Pleno cuenta con una secretaria bajo la responsabilidad de la Dirección Ejecutiva Institucional, que participará con derecho a voz. Le corresponde preparar el orden del día y levantar el acta de cada sesión.